站長(zhǎng)資訊網(wǎng)為應(yīng)對(duì)新冠病毒疫情，NVIDIA宣布，將向全球所有COVID-19新型冠狀病毒研究人員免費(fèi)提供90天的Parabricks軟件使用權(quán)。
NVIDIA Parabricks軟件基于著名的Genome Analysis Toolkit工具包，可通過(guò)GPU加速計(jì)算，將序列數(shù)據(jù)分析的速度提高50倍。
目前，各地科研人員正在對(duì)新?tīng)畈《竞虲OVID-19感染者的基因組進(jìn)行測(cè)序，以了解疾病的傳播方式并確定易感染人群，但分析基因組序列需要耗費(fèi)大量的時(shí)間和計(jì)算力。
Parabricks團(tuán)隊(duì)去年12月剛剛加入NVIDIA，他們的軟件可以在一臺(tái)服務(wù)器上快速分析一個(gè)人的全部基因組變異，并且將分析時(shí)間從傳統(tǒng)的幾天，縮短至一個(gè)小時(shí)以?xún)?nèi)。
鑒于此次疫情史無(wú)前例的傳播速度，如此巨大的提速無(wú)疑將對(duì)了解病毒進(jìn)化、疫苗開(kāi)發(fā)帶來(lái)巨大的推動(dòng)作用。
NVIDIA也在聯(lián)系云服務(wù)供應(yīng)商和超級(jí)計(jì)算中心，爭(zhēng)取提供更多的計(jì)算資源和Parabricks訪(fǎng)問(wèn)途徑。
不過(guò)，只有使用NVIDIA GPU，才能申請(qǐng)并獲得Parabricks軟件的使用權(quán)。
另外，使用Oxford Nanopore long-read數(shù)據(jù)的研究人員，可以GitHub上找到GPU加速工具存儲(chǔ)庫(kù)，以下應(yīng)用也已內(nèi)置NVIDIA GPU加速功能：Medaka、Racon、Raven、 Reticulatus、Unicycler。
